Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms