Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC38Q502W7 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms