Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KNOP1Q1ED39 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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