Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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