Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
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DDB1Q16531 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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DDB1Q16531 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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DDB1Q16531 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DDB1Q16531 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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