Protein–RNA interactions for Protein: Q13610

PWP1, Periodic tryptophan protein 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PWP1Q13610 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PWP1Q13610 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PWP1Q13610 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PWP1Q13610 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PWP1Q13610 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PWP1Q13610 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PWP1Q13610 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PWP1Q13610 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PWP1Q13610 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PWP1Q13610 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PWP1Q13610 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PWP1Q13610 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PWP1Q13610 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PWP1Q13610 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PWP1Q13610 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PWP1Q13610 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PWP1Q13610 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PWP1Q13610 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PWP1Q13610 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PWP1Q13610 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PWP1Q13610 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PWP1Q13610 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PWP1Q13610 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PWP1Q13610 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PWP1Q13610 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PWP1Q13610 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PWP1Q13610 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PWP1Q13610 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PWP1Q13610 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PWP1Q13610 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PWP1Q13610 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PWP1Q13610 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PWP1Q13610 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PWP1Q13610 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PWP1Q13610 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PWP1Q13610 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PWP1Q13610 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PWP1Q13610 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PWP1Q13610 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PWP1Q13610 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PWP1Q13610 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PWP1Q13610 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PWP1Q13610 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PWP1Q13610 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PWP1Q13610 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PWP1Q13610 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PWP1Q13610 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PWP1Q13610 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PWP1Q13610 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PWP1Q13610 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PWP1Q13610 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PWP1Q13610 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PWP1Q13610 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms