Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms