Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD47Q08722 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD47Q08722 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD47Q08722 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD47Q08722 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD47Q08722 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD47Q08722 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD47Q08722 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD47Q08722 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD47Q08722 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD47Q08722 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD47Q08722 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD47Q08722 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD47Q08722 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD47Q08722 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CD47Q08722 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD47Q08722 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD47Q08722 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD47Q08722 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD47Q08722 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD47Q08722 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD47Q08722 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD47Q08722 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD47Q08722 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD47Q08722 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD47Q08722 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD47Q08722 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD47Q08722 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD47Q08722 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD47Q08722 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD47Q08722 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD47Q08722 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD47Q08722 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD47Q08722 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD47Q08722 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD47Q08722 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD47Q08722 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD47Q08722 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD47Q08722 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD47Q08722 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD47Q08722 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD47Q08722 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD47Q08722 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD47Q08722 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD47Q08722 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD47Q08722 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD47Q08722 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD47Q08722 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD47Q08722 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD47Q08722 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD47Q08722 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD47Q08722 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD47Q08722 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD47Q08722 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD47Q08722 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD47Q08722 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CD47Q08722 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD47Q08722 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD47Q08722 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD47Q08722 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD47Q08722 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD47Q08722 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD47Q08722 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD47Q08722 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD47Q08722 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD47Q08722 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD47Q08722 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD47Q08722 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD47Q08722 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD47Q08722 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD47Q08722 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD47Q08722 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD47Q08722 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD47Q08722 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD47Q08722 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD47Q08722 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD47Q08722 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD47Q08722 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD47Q08722 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD47Q08722 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD47Q08722 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD47Q08722 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD47Q08722 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD47Q08722 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CD47Q08722 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD47Q08722 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD47Q08722 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD47Q08722 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD47Q08722 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD47Q08722 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD47Q08722 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD47Q08722 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CD47Q08722 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD47Q08722 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD47Q08722 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD47Q08722 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD47Q08722 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD47Q08722 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD47Q08722 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD47Q08722 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms