Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTDSPL2Q05D32 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTDSPL2Q05D32 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTDSPL2Q05D32 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTDSPL2Q05D32 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTDSPL2Q05D32 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTDSPL2Q05D32 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTDSPL2Q05D32 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTDSPL2Q05D32 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTDSPL2Q05D32 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTDSPL2Q05D32 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTDSPL2Q05D32 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTDSPL2Q05D32 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTDSPL2Q05D32 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTDSPL2Q05D32 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTDSPL2Q05D32 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTDSPL2Q05D32 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTDSPL2Q05D32 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTDSPL2Q05D32 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTDSPL2Q05D32 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTDSPL2Q05D32 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTDSPL2Q05D32 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTDSPL2Q05D32 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTDSPL2Q05D32 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTDSPL2Q05D32 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms