Protein–RNA interactions for Protein: Q01459

CTBS, Di-N-acetylchitobiase, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBSQ01459 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTBSQ01459 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms