Protein–RNA interactions for Protein: P84074

HPCA, Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAP84074 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPCAP84074 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPCAP84074 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPCAP84074 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPCAP84074 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPCAP84074 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPCAP84074 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPCAP84074 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPCAP84074 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPCAP84074 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPCAP84074 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPCAP84074 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPCAP84074 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPCAP84074 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPCAP84074 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPCAP84074 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPCAP84074 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPCAP84074 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPCAP84074 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPCAP84074 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HPCAP84074 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPCAP84074 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPCAP84074 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPCAP84074 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPCAP84074 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPCAP84074 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPCAP84074 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HPCAP84074 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPCAP84074 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPCAP84074 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HPCAP84074 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HPCAP84074 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HPCAP84074 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HPCAP84074 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HPCAP84074 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HPCAP84074 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HPCAP84074 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HPCAP84074 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HPCAP84074 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HPCAP84074 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HPCAP84074 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HPCAP84074 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HPCAP84074 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HPCAP84074 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HPCAP84074 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HPCAP84074 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HPCAP84074 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HPCAP84074 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HPCAP84074 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HPCAP84074 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HPCAP84074 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HPCAP84074 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HPCAP84074 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HPCAP84074 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HPCAP84074 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HPCAP84074 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HPCAP84074 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HPCAP84074 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HPCAP84074 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HPCAP84074 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HPCAP84074 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HPCAP84074 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HPCAP84074 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HPCAP84074 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HPCAP84074 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HPCAP84074 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HPCAP84074 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HPCAP84074 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HPCAP84074 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HPCAP84074 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HPCAP84074 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HPCAP84074 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HPCAP84074 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HPCAP84074 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HPCAP84074 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HPCAP84074 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HPCAP84074 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HPCAP84074 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HPCAP84074 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HPCAP84074 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HPCAP84074 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HPCAP84074 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HPCAP84074 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HPCAP84074 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HPCAP84074 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HPCAP84074 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HPCAP84074 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HPCAP84074 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HPCAP84074 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HPCAP84074 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HPCAP84074 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HPCAP84074 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HPCAP84074 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HPCAP84074 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HPCAP84074 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HPCAP84074 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HPCAP84074 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HPCAP84074 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HPCAP84074 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HPCAP84074 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms