Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA8P53708 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms