Protein–RNA interactions for Protein: P50747

HLCS, Biotin--protein ligase, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLCSP50747 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLCSP50747 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLCSP50747 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLCSP50747 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLCSP50747 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLCSP50747 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLCSP50747 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLCSP50747 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLCSP50747 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLCSP50747 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLCSP50747 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLCSP50747 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLCSP50747 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLCSP50747 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLCSP50747 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLCSP50747 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLCSP50747 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLCSP50747 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLCSP50747 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLCSP50747 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLCSP50747 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLCSP50747 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLCSP50747 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLCSP50747 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLCSP50747 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLCSP50747 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLCSP50747 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HLCSP50747 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLCSP50747 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLCSP50747 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLCSP50747 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLCSP50747 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLCSP50747 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLCSP50747 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLCSP50747 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLCSP50747 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLCSP50747 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLCSP50747 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLCSP50747 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLCSP50747 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLCSP50747 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLCSP50747 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLCSP50747 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLCSP50747 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLCSP50747 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLCSP50747 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLCSP50747 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLCSP50747 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLCSP50747 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLCSP50747 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLCSP50747 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLCSP50747 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLCSP50747 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLCSP50747 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLCSP50747 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLCSP50747 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLCSP50747 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLCSP50747 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLCSP50747 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HLCSP50747 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLCSP50747 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLCSP50747 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLCSP50747 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HLCSP50747 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLCSP50747 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLCSP50747 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HLCSP50747 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLCSP50747 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLCSP50747 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLCSP50747 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLCSP50747 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLCSP50747 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLCSP50747 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLCSP50747 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLCSP50747 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLCSP50747 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLCSP50747 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLCSP50747 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLCSP50747 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLCSP50747 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLCSP50747 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLCSP50747 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLCSP50747 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLCSP50747 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLCSP50747 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLCSP50747 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLCSP50747 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLCSP50747 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HLCSP50747 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HLCSP50747 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HLCSP50747 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HLCSP50747 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HLCSP50747 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HLCSP50747 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HLCSP50747 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HLCSP50747 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HLCSP50747 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HLCSP50747 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HLCSP50747 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLCSP50747 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms