Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL1P40616 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL1P40616 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL1P40616 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL1P40616 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL1P40616 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL1P40616 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL1P40616 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL1P40616 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL1P40616 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL1P40616 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARL1P40616 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARL1P40616 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ARL1P40616 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARL1P40616 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ARL1P40616 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARL1P40616 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARL1P40616 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARL1P40616 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARL1P40616 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARL1P40616 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARL1P40616 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARL1P40616 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARL1P40616 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARL1P40616 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARL1P40616 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARL1P40616 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ARL1P40616 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARL1P40616 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARL1P40616 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARL1P40616 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARL1P40616 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARL1P40616 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARL1P40616 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARL1P40616 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARL1P40616 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARL1P40616 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARL1P40616 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARL1P40616 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARL1P40616 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARL1P40616 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARL1P40616 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARL1P40616 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARL1P40616 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARL1P40616 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARL1P40616 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARL1P40616 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARL1P40616 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARL1P40616 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARL1P40616 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARL1P40616 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARL1P40616 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARL1P40616 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARL1P40616 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARL1P40616 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARL1P40616 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARL1P40616 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARL1P40616 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARL1P40616 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARL1P40616 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARL1P40616 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARL1P40616 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARL1P40616 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARL1P40616 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARL1P40616 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARL1P40616 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARL1P40616 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARL1P40616 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARL1P40616 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARL1P40616 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARL1P40616 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARL1P40616 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARL1P40616 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARL1P40616 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARL1P40616 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARL1P40616 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARL1P40616 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARL1P40616 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARL1P40616 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARL1P40616 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARL1P40616 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARL1P40616 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARL1P40616 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARL1P40616 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARL1P40616 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARL1P40616 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARL1P40616 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARL1P40616 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARL1P40616 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARL1P40616 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARL1P40616 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARL1P40616 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARL1P40616 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARL1P40616 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARL1P40616 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARL1P40616 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARL1P40616 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARL1P40616 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARL1P40616 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARL1P40616 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms