Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PSMB9P28065 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PSMB9P28065 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PSMB9P28065 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PSMB9P28065 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PSMB9P28065 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PSMB9P28065 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PSMB9P28065 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB9P28065 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB9P28065 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB9P28065 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB9P28065 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB9P28065 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PSMB9P28065 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB9P28065 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB9P28065 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PSMB9P28065 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB9P28065 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PSMB9P28065 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB9P28065 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB9P28065 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB9P28065 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB9P28065 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB9P28065 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB9P28065 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB9P28065 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB9P28065 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB9P28065 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB9P28065 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB9P28065 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB9P28065 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB9P28065 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB9P28065 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB9P28065 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB9P28065 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB9P28065 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB9P28065 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB9P28065 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PSMB9P28065 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB9P28065 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB9P28065 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB9P28065 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB9P28065 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB9P28065 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB9P28065 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB9P28065 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB9P28065 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB9P28065 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB9P28065 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PSMB9P28065 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB9P28065 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB9P28065 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB9P28065 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB9P28065 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB9P28065 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB9P28065 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB9P28065 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB9P28065 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB9P28065 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB9P28065 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB9P28065 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB9P28065 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PSMB9P28065 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PSMB9P28065 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB9P28065 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB9P28065 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB9P28065 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB9P28065 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PSMB9P28065 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB9P28065 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB9P28065 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB9P28065 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB9P28065 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB9P28065 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB9P28065 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB9P28065 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB9P28065 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB9P28065 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB9P28065 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB9P28065 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB9P28065 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB9P28065 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB9P28065 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB9P28065 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB9P28065 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB9P28065 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PSMB9P28065 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB9P28065 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB9P28065 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB9P28065 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB9P28065 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB9P28065 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMB9P28065 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB9P28065 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB9P28065 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB9P28065 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB9P28065 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB9P28065 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB9P28065 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PSMB9P28065 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms