Protein–RNA interactions for Protein: P23409

MYF6, Myogenic factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF6P23409 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MYF6P23409 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MYF6P23409 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MYF6P23409 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MYF6P23409 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MYF6P23409 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MYF6P23409 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MYF6P23409 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MYF6P23409 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MYF6P23409 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MYF6P23409 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MYF6P23409 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MYF6P23409 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MYF6P23409 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MYF6P23409 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MYF6P23409 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MYF6P23409 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MYF6P23409 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MYF6P23409 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
MYF6P23409 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MYF6P23409 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MYF6P23409 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MYF6P23409 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MYF6P23409 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MYF6P23409 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MYF6P23409 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MYF6P23409 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MYF6P23409 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MYF6P23409 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MYF6P23409 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MYF6P23409 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MYF6P23409 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MYF6P23409 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MYF6P23409 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MYF6P23409 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MYF6P23409 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MYF6P23409 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MYF6P23409 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MYF6P23409 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MYF6P23409 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MYF6P23409 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MYF6P23409 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MYF6P23409 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MYF6P23409 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MYF6P23409 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MYF6P23409 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MYF6P23409 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MYF6P23409 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MYF6P23409 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MYF6P23409 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MYF6P23409 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MYF6P23409 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MYF6P23409 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MYF6P23409 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MYF6P23409 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MYF6P23409 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MYF6P23409 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MYF6P23409 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MYF6P23409 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MYF6P23409 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MYF6P23409 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MYF6P23409 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MYF6P23409 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MYF6P23409 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MYF6P23409 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MYF6P23409 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MYF6P23409 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MYF6P23409 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYF6P23409 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYF6P23409 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYF6P23409 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYF6P23409 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYF6P23409 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYF6P23409 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYF6P23409 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYF6P23409 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYF6P23409 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYF6P23409 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYF6P23409 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYF6P23409 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYF6P23409 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYF6P23409 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYF6P23409 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYF6P23409 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYF6P23409 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYF6P23409 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYF6P23409 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYF6P23409 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYF6P23409 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYF6P23409 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYF6P23409 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYF6P23409 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYF6P23409 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYF6P23409 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYF6P23409 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYF6P23409 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYF6P23409 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYF6P23409 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYF6P23409 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYF6P23409 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms