Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD247P20963 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD247P20963 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD247P20963 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD247P20963 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD247P20963 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD247P20963 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD247P20963 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD247P20963 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD247P20963 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD247P20963 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD247P20963 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD247P20963 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CD247P20963 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CD247P20963 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD247P20963 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CD247P20963 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD247P20963 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD247P20963 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD247P20963 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD247P20963 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD247P20963 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD247P20963 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CD247P20963 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD247P20963 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD247P20963 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD247P20963 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD247P20963 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD247P20963 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD247P20963 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD247P20963 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD247P20963 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD247P20963 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD247P20963 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD247P20963 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD247P20963 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD247P20963 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD247P20963 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD247P20963 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD247P20963 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD247P20963 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD247P20963 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD247P20963 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD247P20963 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD247P20963 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD247P20963 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CD247P20963 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD247P20963 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD247P20963 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD247P20963 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD247P20963 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD247P20963 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD247P20963 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD247P20963 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD247P20963 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CD247P20963 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD247P20963 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD247P20963 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD247P20963 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD247P20963 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD247P20963 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD247P20963 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD247P20963 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD247P20963 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD247P20963 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD247P20963 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD247P20963 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD247P20963 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD247P20963 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD247P20963 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD247P20963 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD247P20963 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CD247P20963 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD247P20963 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CD247P20963 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD247P20963 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD247P20963 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD247P20963 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD247P20963 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD247P20963 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD247P20963 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD247P20963 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD247P20963 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD247P20963 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD247P20963 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD247P20963 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD247P20963 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CD247P20963 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD247P20963 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD247P20963 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD247P20963 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD247P20963 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD247P20963 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD247P20963 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD247P20963 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD247P20963 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD247P20963 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD247P20963 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD247P20963 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD247P20963 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms