Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPI1P17947 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPI1P17947 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPI1P17947 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPI1P17947 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPI1P17947 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPI1P17947 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPI1P17947 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPI1P17947 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPI1P17947 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPI1P17947 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPI1P17947 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPI1P17947 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPI1P17947 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPI1P17947 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPI1P17947 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPI1P17947 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPI1P17947 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPI1P17947 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPI1P17947 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPI1P17947 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPI1P17947 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SPI1P17947 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SPI1P17947 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPI1P17947 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SPI1P17947 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPI1P17947 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SPI1P17947 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SPI1P17947 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPI1P17947 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPI1P17947 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPI1P17947 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPI1P17947 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SPI1P17947 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPI1P17947 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SPI1P17947 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPI1P17947 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPI1P17947 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPI1P17947 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPI1P17947 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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SPI1P17947 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPI1P17947 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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SPI1P17947 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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SPI1P17947 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPI1P17947 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPI1P17947 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPI1P17947 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPI1P17947 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPI1P17947 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPI1P17947 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPI1P17947 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPI1P17947 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPI1P17947 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPI1P17947 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPI1P17947 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPI1P17947 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPI1P17947 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPI1P17947 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPI1P17947 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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SPI1P17947 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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SPI1P17947 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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SPI1P17947 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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SPI1P17947 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SPI1P17947 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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SPI1P17947 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPI1P17947 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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SPI1P17947 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPI1P17947 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPI1P17947 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPI1P17947 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPI1P17947 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPI1P17947 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPI1P17947 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPI1P17947 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPI1P17947 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPI1P17947 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPI1P17947 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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