Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms