Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BMP3P12645 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BMP3P12645 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BMP3P12645 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BMP3P12645 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BMP3P12645 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BMP3P12645 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BMP3P12645 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BMP3P12645 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BMP3P12645 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BMP3P12645 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BMP3P12645 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BMP3P12645 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BMP3P12645 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.62
BMP3P12645 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BMP3P12645 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BMP3P12645 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BMP3P12645 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BMP3P12645 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BMP3P12645 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BMP3P12645 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BMP3P12645 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BMP3P12645 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BMP3P12645 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BMP3P12645 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BMP3P12645 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BMP3P12645 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BMP3P12645 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BMP3P12645 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BMP3P12645 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BMP3P12645 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
BMP3P12645 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BMP3P12645 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BMP3P12645 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BMP3P12645 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BMP3P12645 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BMP3P12645 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
BMP3P12645 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BMP3P12645 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BMP3P12645 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BMP3P12645 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BMP3P12645 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BMP3P12645 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BMP3P12645 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BMP3P12645 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BMP3P12645 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BMP3P12645 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BMP3P12645 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BMP3P12645 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
BMP3P12645 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BMP3P12645 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BMP3P12645 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BMP3P12645 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BMP3P12645 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BMP3P12645 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BMP3P12645 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BMP3P12645 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BMP3P12645 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BMP3P12645 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BMP3P12645 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BMP3P12645 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BMP3P12645 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BMP3P12645 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BMP3P12645 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BMP3P12645 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BMP3P12645 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BMP3P12645 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BMP3P12645 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BMP3P12645 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
BMP3P12645 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BMP3P12645 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
BMP3P12645 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BMP3P12645 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BMP3P12645 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BMP3P12645 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BMP3P12645 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
BMP3P12645 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BMP3P12645 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BMP3P12645 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BMP3P12645 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BMP3P12645 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BMP3P12645 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BMP3P12645 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BMP3P12645 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BMP3P12645 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BMP3P12645 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BMP3P12645 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BMP3P12645 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BMP3P12645 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BMP3P12645 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BMP3P12645 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BMP3P12645 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
BMP3P12645 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BMP3P12645 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BMP3P12645 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BMP3P12645 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BMP3P12645 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BMP3P12645 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BMP3P12645 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BMP3P12645 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms