Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms