Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F8A0AVK6 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms