Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKZ1

CNOT11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT11Q9UKZ1 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNOT11Q9UKZ1 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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