Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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