Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUP58Q9BVL2 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms