Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR3CQ9BUI4 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms