Protein–RNA interactions for Protein: Q96EM0

L3HYPDH, Trans-3-hydroxy-L-proline dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L3HYPDHQ96EM0 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
L3HYPDHQ96EM0 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms