Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME9Q86XW9 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms