Protein–RNA interactions for Protein: Q76I76

SSH2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH2Q76I76 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSH2Q76I76 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSH2Q76I76 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSH2Q76I76 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SSH2Q76I76 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSH2Q76I76 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSH2Q76I76 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSH2Q76I76 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSH2Q76I76 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSH2Q76I76 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SSH2Q76I76 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SSH2Q76I76 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SSH2Q76I76 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SSH2Q76I76 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SSH2Q76I76 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SSH2Q76I76 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSH2Q76I76 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSH2Q76I76 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSH2Q76I76 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSH2Q76I76 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSH2Q76I76 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSH2Q76I76 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSH2Q76I76 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSH2Q76I76 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSH2Q76I76 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSH2Q76I76 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSH2Q76I76 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSH2Q76I76 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSH2Q76I76 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSH2Q76I76 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSH2Q76I76 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSH2Q76I76 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SSH2Q76I76 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SSH2Q76I76 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSH2Q76I76 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSH2Q76I76 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSH2Q76I76 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSH2Q76I76 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SSH2Q76I76 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SSH2Q76I76 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSH2Q76I76 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSH2Q76I76 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSH2Q76I76 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSH2Q76I76 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSH2Q76I76 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSH2Q76I76 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSH2Q76I76 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SSH2Q76I76 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SSH2Q76I76 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SSH2Q76I76 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SSH2Q76I76 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SSH2Q76I76 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SSH2Q76I76 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SSH2Q76I76 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SSH2Q76I76 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SSH2Q76I76 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SSH2Q76I76 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SSH2Q76I76 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SSH2Q76I76 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SSH2Q76I76 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SSH2Q76I76 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SSH2Q76I76 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SSH2Q76I76 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SSH2Q76I76 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SSH2Q76I76 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SSH2Q76I76 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SSH2Q76I76 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SSH2Q76I76 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SSH2Q76I76 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SSH2Q76I76 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SSH2Q76I76 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SSH2Q76I76 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SSH2Q76I76 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SSH2Q76I76 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSH2Q76I76 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSH2Q76I76 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSH2Q76I76 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSH2Q76I76 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSH2Q76I76 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSH2Q76I76 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSH2Q76I76 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSH2Q76I76 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSH2Q76I76 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSH2Q76I76 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSH2Q76I76 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSH2Q76I76 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSH2Q76I76 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSH2Q76I76 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSH2Q76I76 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SSH2Q76I76 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSH2Q76I76 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSH2Q76I76 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSH2Q76I76 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSH2Q76I76 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSH2Q76I76 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSH2Q76I76 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSH2Q76I76 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSH2Q76I76 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSH2Q76I76 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSH2Q76I76 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms