Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXD1

HRCT1, Histidine-rich carboxyl terminus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCT1Q6UXD1 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HRCT1Q6UXD1 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms