Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 NAE1-210ENST00000563221 532 ntTSL 26.67□□□□□ -1.342e-7■■■■■ 28
PRPF8Q6P2Q9 NAE1-219ENST00000568672 523 ntTSL 26.67□□□□□ -1.342e-7■■■■■ 28
PRPF8Q6P2Q9 PSMC2-201ENST00000292644 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.362e-7■■■■■ 28
PRPF8Q6P2Q9 PSMC2-203ENST00000435765 3054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.372e-7■■■■■ 28
PRPF8Q6P2Q9 PRRC2B-206ENST00000456307 525 ntTSL 26.37□□□□□ -1.394e-10■■■■■ 28
PRPF8Q6P2Q9 EFTUD2-208ENST00000587914 562 ntTSL 45.32□□□□□ -1.562e-7■■■■■ 28
PRPF8Q6P2Q9 CCAR1-208ENST00000536391 552 ntTSL 45.26□□□□□ -1.572e-7■■■■■ 28
PRPF8Q6P2Q9 VPS13B-205ENST00000493587 3485 ntTSL 25.02□□□□□ -1.612e-7■■■■■ 28
PRPF8Q6P2Q9 ROCK2-204ENST00000431087 729 ntTSL 34.98□□□□□ -1.612e-7■■■■■ 28
PRPF8Q6P2Q9 PITHD1-203ENST00000415372 754 ntTSL 22.61□□□□□ -1.992e-7■■■■■ 28
PRPF8Q6P2Q9 PPP2CA-202ENST00000472253 574 ntTSL 21.52□□□□□ -2.172e-7■■■■■ 28
PRPF8Q6P2Q9 BAZ1B-203ENST00000466844 827 ntTSL 41.21□□□□□ -2.222e-7■■■■■ 28
PRPF8Q6P2Q9 NAE1-206ENST00000562074 571 ntTSL 21.01□□□□□ -2.252e-7■■■■■ 28
PRPF8Q6P2Q9 NAE1-207ENST00000562428 473 ntTSL 50.87□□□□□ -2.272e-7■■■■■ 28
PRPF8Q6P2Q9 FAM133B-209ENST00000490747 717 ntTSL 3-1.05□□□□□ -2.582e-7■■■■■ 28
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PRPF8Q6P2Q9 PSME3-208ENST00000586312 752 ntTSL 511.91□□□□□ -0.55e-8■■■■■ 28
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PRPF8Q6P2Q9 SLC12A2-206ENST00000509205 4263 ntTSL 1 (best)15.8■□□□□ 0.122e-7■■■■■ 28
PRPF8Q6P2Q9 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.142e-7■■■■■ 28
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PRPF8Q6P2Q9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.77e-7■■■■■ 28
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PRPF8Q6P2Q9 ULK3-214ENST00000567472 841 ntTSL 316.57■□□□□ 0.246e-8■■■■■ 28
PRPF8Q6P2Q9 CCDC93-207ENST00000474006 467 ntTSL 36.03□□□□□ -1.442e-7■■■■■ 28
PRPF8Q6P2Q9 FBXW5-203ENST00000443788 839 ntTSL 222.56■■□□□ 1.21e-6■■■■■ 28
PRPF8Q6P2Q9 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.254e-7■■■■■ 28
PRPF8Q6P2Q9 ZNF707-210ENST00000526970 562 ntTSL 59.6□□□□□ -0.874e-7■■■■■ 28
PRPF8Q6P2Q9 LONP2-206ENST00000565867 1969 ntTSL 37.91□□□□□ -1.145e-8■■■■■ 28
PRPF8Q6P2Q9 TMEM120B-207ENST00000541467 2959 ntTSL 59.88□□□□□ -0.834e-7■■■■■ 28
PRPF8Q6P2Q9 RECQL4-208ENST00000534626 1165 ntTSL 514.58□□□□□ -0.084e-9■■■■■ 28
PRPF8Q6P2Q9 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.494e-19■■■■■ 28
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PRPF8Q6P2Q9 DBI-202ENST00000355857 637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.774e-19■■■■■ 28
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PRPF8Q6P2Q9 RAB24-203ENST00000393610 870 ntTSL 514.61□□□□□ -0.071e-7■■■■■ 28
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PRPF8Q6P2Q9 VMA21-201ENST00000330374 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.444e-14■■■■■ 27.9
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PRPF8Q6P2Q9 PLEC-214ENST00000528131 564 ntTSL 316.17■□□□□ 0.184e-7■■■■■ 27.9
PRPF8Q6P2Q9 WSB1-207ENST00000579733 1670 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.792e-10■■■■■ 27.9
PRPF8Q6P2Q9 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC13.44□□□□□ -0.269e-10■■■■■ 27.9
PRPF8Q6P2Q9 POLD2-210ENST00000463464 707 ntTSL 210.02□□□□□ -0.82e-7■■■■■ 27.9
PRPF8Q6P2Q9 MRPL38-205ENST00000471434 550 ntTSL 410.41□□□□□ -0.744e-8■■■■■ 27.9
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PRPF8Q6P2Q9 TPT1-208ENST00000527226 613 ntTSL 211.72□□□□□ -0.535e-9■■■■■ 27.9
PRPF8Q6P2Q9 TPT1-201ENST00000309246 1008 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.715e-9■■■■■ 27.9
PRPF8Q6P2Q9 TPT1-203ENST00000379056 1101 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.715e-9■■■■■ 27.9
PRPF8Q6P2Q9 TPT1-212ENST00000530705 4735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.775e-9■■■■■ 27.9
PRPF8Q6P2Q9 TPT1-214ENST00000616577 4814 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.015e-9■■■■■ 27.9
PRPF8Q6P2Q9 TPT1-207ENST00000490277 1851 ntTSL 27.56□□□□□ -1.25e-9■■■■■ 27.9
PRPF8Q6P2Q9 TPT1-204ENST00000379060 764 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.625e-9■■■■■ 27.9
PRPF8Q6P2Q9 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.665e-10■■■■■ 27.9
PRPF8Q6P2Q9 MBTD1-202ENST00000405860 3224 ntTSL 59.81□□□□□ -0.845e-10■■■■■ 27.9
PRPF8Q6P2Q9 MBTD1-203ENST00000415868 5099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.35e-10■■■■■ 27.9
PRPF8Q6P2Q9 PSMC3-203ENST00000526993 580 ntTSL 216.56■□□□□ 0.244e-9■■■■■ 27.9
PRPF8Q6P2Q9 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.184e-10■■■■■ 27.9
PRPF8Q6P2Q9 BOLA3-203ENST00000469676 1436 ntTSL 514.98□□□□□ -0.014e-10■■■■■ 27.9
PRPF8Q6P2Q9 BOLA3-205ENST00000484655 2982 ntTSL 1 (best)14.51□□□□□ -0.094e-10■■■■■ 27.9
PRPF8Q6P2Q9 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.364e-10■■■■■ 27.9
PRPF8Q6P2Q9 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.632e-7■■■■■ 27.9
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