Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms