Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUD6

FAM69B, Protein FAM69B, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM69BQ5VUD6 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms