Protein–RNA interactions for Protein: Q499Z3

SLFNL1, Schlafen-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFNL1Q499Z3 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLFNL1Q499Z3 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLFNL1Q499Z3 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLFNL1Q499Z3 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLFNL1Q499Z3 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLFNL1Q499Z3 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLFNL1Q499Z3 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLFNL1Q499Z3 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLFNL1Q499Z3 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLFNL1Q499Z3 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLFNL1Q499Z3 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLFNL1Q499Z3 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLFNL1Q499Z3 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLFNL1Q499Z3 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLFNL1Q499Z3 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLFNL1Q499Z3 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SLFNL1Q499Z3 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLFNL1Q499Z3 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLFNL1Q499Z3 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLFNL1Q499Z3 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SLFNL1Q499Z3 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SLFNL1Q499Z3 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLFNL1Q499Z3 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLFNL1Q499Z3 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLFNL1Q499Z3 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLFNL1Q499Z3 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLFNL1Q499Z3 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLFNL1Q499Z3 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLFNL1Q499Z3 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLFNL1Q499Z3 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLFNL1Q499Z3 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLFNL1Q499Z3 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLFNL1Q499Z3 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLFNL1Q499Z3 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLFNL1Q499Z3 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLFNL1Q499Z3 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLFNL1Q499Z3 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLFNL1Q499Z3 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLFNL1Q499Z3 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLFNL1Q499Z3 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLFNL1Q499Z3 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLFNL1Q499Z3 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLFNL1Q499Z3 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLFNL1Q499Z3 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLFNL1Q499Z3 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLFNL1Q499Z3 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLFNL1Q499Z3 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLFNL1Q499Z3 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLFNL1Q499Z3 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLFNL1Q499Z3 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLFNL1Q499Z3 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLFNL1Q499Z3 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SLFNL1Q499Z3 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SLFNL1Q499Z3 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SLFNL1Q499Z3 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLFNL1Q499Z3 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SLFNL1Q499Z3 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SLFNL1Q499Z3 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SLFNL1Q499Z3 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SLFNL1Q499Z3 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SLFNL1Q499Z3 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
SLFNL1Q499Z3 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SLFNL1Q499Z3 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SLFNL1Q499Z3 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SLFNL1Q499Z3 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SLFNL1Q499Z3 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
SLFNL1Q499Z3 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SLFNL1Q499Z3 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SLFNL1Q499Z3 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SLFNL1Q499Z3 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SLFNL1Q499Z3 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SLFNL1Q499Z3 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SLFNL1Q499Z3 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SLFNL1Q499Z3 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SLFNL1Q499Z3 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLFNL1Q499Z3 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLFNL1Q499Z3 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLFNL1Q499Z3 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLFNL1Q499Z3 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLFNL1Q499Z3 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLFNL1Q499Z3 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLFNL1Q499Z3 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLFNL1Q499Z3 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLFNL1Q499Z3 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLFNL1Q499Z3 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLFNL1Q499Z3 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLFNL1Q499Z3 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLFNL1Q499Z3 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLFNL1Q499Z3 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SLFNL1Q499Z3 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLFNL1Q499Z3 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLFNL1Q499Z3 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLFNL1Q499Z3 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLFNL1Q499Z3 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLFNL1Q499Z3 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLFNL1Q499Z3 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLFNL1Q499Z3 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLFNL1Q499Z3 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLFNL1Q499Z3 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLFNL1Q499Z3 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms