Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

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Length 746 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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EXT1Q16394 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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EXT1Q16394 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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EXT1Q16394 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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