Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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NEDD8Q15843 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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NEDD8Q15843 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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