Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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SEC23BQ15437 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
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SEC23BQ15437 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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SEC23BQ15437 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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SEC23BQ15437 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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SEC23BQ15437 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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SEC23BQ15437 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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SEC23BQ15437 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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SEC23BQ15437 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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SEC23BQ15437 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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SEC23BQ15437 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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SEC23BQ15437 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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SEC23BQ15437 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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