Protein–RNA interactions for Protein: Q13131

PRKAA1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA1Q13131 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PRKAA1Q13131 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PRKAA1Q13131 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PRKAA1Q13131 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PRKAA1Q13131 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PRKAA1Q13131 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PRKAA1Q13131 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PRKAA1Q13131 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PRKAA1Q13131 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PRKAA1Q13131 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKAA1Q13131 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKAA1Q13131 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKAA1Q13131 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKAA1Q13131 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKAA1Q13131 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKAA1Q13131 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKAA1Q13131 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKAA1Q13131 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKAA1Q13131 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKAA1Q13131 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKAA1Q13131 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKAA1Q13131 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKAA1Q13131 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKAA1Q13131 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKAA1Q13131 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKAA1Q13131 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKAA1Q13131 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKAA1Q13131 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKAA1Q13131 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKAA1Q13131 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKAA1Q13131 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKAA1Q13131 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKAA1Q13131 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKAA1Q13131 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKAA1Q13131 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKAA1Q13131 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKAA1Q13131 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKAA1Q13131 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKAA1Q13131 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKAA1Q13131 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKAA1Q13131 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKAA1Q13131 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKAA1Q13131 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKAA1Q13131 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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PRKAA1Q13131 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKAA1Q13131 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKAA1Q13131 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKAA1Q13131 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKAA1Q13131 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKAA1Q13131 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKAA1Q13131 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKAA1Q13131 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKAA1Q13131 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKAA1Q13131 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKAA1Q13131 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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PRKAA1Q13131 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKAA1Q13131 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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PRKAA1Q13131 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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PRKAA1Q13131 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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PRKAA1Q13131 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKAA1Q13131 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKAA1Q13131 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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PRKAA1Q13131 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKAA1Q13131 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKAA1Q13131 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKAA1Q13131 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKAA1Q13131 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKAA1Q13131 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKAA1Q13131 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKAA1Q13131 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKAA1Q13131 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKAA1Q13131 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKAA1Q13131 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKAA1Q13131 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKAA1Q13131 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKAA1Q13131 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKAA1Q13131 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKAA1Q13131 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKAA1Q13131 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKAA1Q13131 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKAA1Q13131 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKAA1Q13131 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKAA1Q13131 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKAA1Q13131 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKAA1Q13131 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKAA1Q13131 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKAA1Q13131 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKAA1Q13131 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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