Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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