Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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