Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRB1P82279 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRB1P82279 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRB1P82279 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRB1P82279 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRB1P82279 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRB1P82279 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRB1P82279 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRB1P82279 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRB1P82279 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRB1P82279 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRB1P82279 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRB1P82279 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRB1P82279 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRB1P82279 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRB1P82279 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRB1P82279 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRB1P82279 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRB1P82279 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRB1P82279 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRB1P82279 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CRB1P82279 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRB1P82279 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRB1P82279 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRB1P82279 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRB1P82279 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRB1P82279 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRB1P82279 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRB1P82279 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRB1P82279 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRB1P82279 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRB1P82279 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRB1P82279 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CRB1P82279 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CRB1P82279 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRB1P82279 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CRB1P82279 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRB1P82279 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRB1P82279 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRB1P82279 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRB1P82279 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRB1P82279 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CRB1P82279 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRB1P82279 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRB1P82279 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRB1P82279 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRB1P82279 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRB1P82279 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRB1P82279 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRB1P82279 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRB1P82279 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRB1P82279 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRB1P82279 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRB1P82279 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRB1P82279 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CRB1P82279 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRB1P82279 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRB1P82279 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRB1P82279 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRB1P82279 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRB1P82279 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CRB1P82279 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRB1P82279 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRB1P82279 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRB1P82279 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRB1P82279 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRB1P82279 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRB1P82279 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRB1P82279 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRB1P82279 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRB1P82279 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRB1P82279 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRB1P82279 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRB1P82279 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CRB1P82279 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRB1P82279 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRB1P82279 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRB1P82279 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRB1P82279 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRB1P82279 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRB1P82279 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRB1P82279 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRB1P82279 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRB1P82279 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRB1P82279 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRB1P82279 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRB1P82279 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRB1P82279 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRB1P82279 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRB1P82279 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRB1P82279 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRB1P82279 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRB1P82279 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRB1P82279 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CRB1P82279 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRB1P82279 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRB1P82279 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRB1P82279 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRB1P82279 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRB1P82279 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms