Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSNK2A1P68400 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms