Protein–RNA interactions for Protein: P50747

HLCS, Biotin--protein ligase, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLCSP50747 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLCSP50747 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HLCSP50747 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HLCSP50747 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLCSP50747 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLCSP50747 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HLCSP50747 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLCSP50747 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLCSP50747 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLCSP50747 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLCSP50747 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLCSP50747 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLCSP50747 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLCSP50747 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLCSP50747 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLCSP50747 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLCSP50747 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLCSP50747 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLCSP50747 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLCSP50747 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLCSP50747 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLCSP50747 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLCSP50747 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HLCSP50747 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLCSP50747 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLCSP50747 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLCSP50747 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLCSP50747 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLCSP50747 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLCSP50747 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLCSP50747 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLCSP50747 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLCSP50747 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLCSP50747 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLCSP50747 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLCSP50747 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLCSP50747 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLCSP50747 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLCSP50747 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLCSP50747 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLCSP50747 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLCSP50747 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HLCSP50747 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HLCSP50747 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLCSP50747 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLCSP50747 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLCSP50747 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HLCSP50747 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLCSP50747 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLCSP50747 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLCSP50747 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLCSP50747 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLCSP50747 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLCSP50747 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLCSP50747 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HLCSP50747 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLCSP50747 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLCSP50747 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLCSP50747 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLCSP50747 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLCSP50747 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLCSP50747 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HLCSP50747 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLCSP50747 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLCSP50747 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLCSP50747 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLCSP50747 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLCSP50747 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLCSP50747 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLCSP50747 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLCSP50747 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLCSP50747 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLCSP50747 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLCSP50747 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLCSP50747 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLCSP50747 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLCSP50747 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLCSP50747 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLCSP50747 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLCSP50747 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HLCSP50747 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLCSP50747 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLCSP50747 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLCSP50747 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLCSP50747 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLCSP50747 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLCSP50747 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLCSP50747 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLCSP50747 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLCSP50747 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLCSP50747 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HLCSP50747 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLCSP50747 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLCSP50747 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLCSP50747 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLCSP50747 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HLCSP50747 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLCSP50747 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLCSP50747 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLCSP50747 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms