Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERFP50548 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERFP50548 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERFP50548 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERFP50548 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ERFP50548 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERFP50548 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERFP50548 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERFP50548 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERFP50548 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ERFP50548 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ERFP50548 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERFP50548 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERFP50548 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERFP50548 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERFP50548 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERFP50548 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERFP50548 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERFP50548 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERFP50548 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERFP50548 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERFP50548 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERFP50548 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ERFP50548 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERFP50548 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERFP50548 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERFP50548 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERFP50548 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERFP50548 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERFP50548 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERFP50548 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERFP50548 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERFP50548 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERFP50548 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERFP50548 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERFP50548 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERFP50548 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERFP50548 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERFP50548 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERFP50548 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERFP50548 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERFP50548 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERFP50548 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERFP50548 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERFP50548 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERFP50548 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERFP50548 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERFP50548 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERFP50548 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERFP50548 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERFP50548 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERFP50548 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERFP50548 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERFP50548 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERFP50548 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERFP50548 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERFP50548 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERFP50548 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERFP50548 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERFP50548 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERFP50548 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERFP50548 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERFP50548 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERFP50548 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERFP50548 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERFP50548 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERFP50548 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERFP50548 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERFP50548 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERFP50548 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERFP50548 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERFP50548 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERFP50548 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERFP50548 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ERFP50548 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERFP50548 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERFP50548 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERFP50548 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERFP50548 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERFP50548 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERFP50548 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERFP50548 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERFP50548 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERFP50548 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERFP50548 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERFP50548 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERFP50548 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERFP50548 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERFP50548 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERFP50548 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERFP50548 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERFP50548 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERFP50548 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERFP50548 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ERFP50548 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERFP50548 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERFP50548 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERFP50548 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERFP50548 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERFP50548 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms