Protein–RNA interactions for Protein: P28360

MSX1, Homeobox protein MSX-1, humanhuman

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSX1P28360 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MSX1P28360 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MSX1P28360 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MSX1P28360 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MSX1P28360 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MSX1P28360 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MSX1P28360 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MSX1P28360 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MSX1P28360 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MSX1P28360 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MSX1P28360 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MSX1P28360 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MSX1P28360 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MSX1P28360 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MSX1P28360 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MSX1P28360 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MSX1P28360 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MSX1P28360 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MSX1P28360 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MSX1P28360 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MSX1P28360 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MSX1P28360 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MSX1P28360 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MSX1P28360 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MSX1P28360 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MSX1P28360 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MSX1P28360 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MSX1P28360 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MSX1P28360 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MSX1P28360 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MSX1P28360 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MSX1P28360 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MSX1P28360 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MSX1P28360 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MSX1P28360 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MSX1P28360 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MSX1P28360 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MSX1P28360 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MSX1P28360 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MSX1P28360 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MSX1P28360 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MSX1P28360 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MSX1P28360 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MSX1P28360 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MSX1P28360 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MSX1P28360 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MSX1P28360 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MSX1P28360 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MSX1P28360 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MSX1P28360 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MSX1P28360 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MSX1P28360 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MSX1P28360 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MSX1P28360 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MSX1P28360 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MSX1P28360 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MSX1P28360 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MSX1P28360 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MSX1P28360 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MSX1P28360 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MSX1P28360 Z99916.3-201ENST00000623422 1080 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MSX1P28360 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MSX1P28360 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MSX1P28360 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MSX1P28360 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MSX1P28360 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MSX1P28360 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MSX1P28360 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MSX1P28360 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MSX1P28360 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MSX1P28360 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSX1P28360 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSX1P28360 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSX1P28360 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSX1P28360 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSX1P28360 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSX1P28360 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSX1P28360 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSX1P28360 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSX1P28360 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSX1P28360 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MSX1P28360 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSX1P28360 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSX1P28360 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSX1P28360 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSX1P28360 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MSX1P28360 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSX1P28360 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSX1P28360 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSX1P28360 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSX1P28360 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSX1P28360 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSX1P28360 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSX1P28360 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSX1P28360 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSX1P28360 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSX1P28360 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MSX1P28360 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSX1P28360 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSX1P28360 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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