Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms