Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB9P17482 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms