Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TO15178 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TO15178 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TO15178 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TO15178 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TO15178 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TO15178 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TO15178 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TO15178 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TO15178 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TO15178 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TO15178 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TO15178 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TO15178 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TO15178 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TO15178 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TO15178 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TO15178 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TO15178 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TO15178 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TO15178 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TO15178 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TO15178 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TO15178 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TO15178 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TO15178 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TO15178 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TO15178 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TO15178 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TO15178 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TO15178 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TO15178 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TO15178 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TO15178 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TO15178 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TO15178 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TO15178 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TO15178 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TO15178 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TO15178 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TO15178 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TO15178 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TO15178 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TO15178 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TO15178 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TO15178 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TO15178 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TO15178 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TO15178 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TO15178 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TO15178 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TO15178 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TO15178 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TO15178 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TO15178 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TO15178 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TO15178 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TO15178 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TO15178 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TO15178 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TO15178 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TO15178 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TO15178 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TO15178 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TO15178 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TO15178 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TO15178 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TO15178 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TO15178 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TO15178 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TO15178 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TO15178 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TO15178 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TO15178 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TO15178 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TO15178 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TO15178 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TO15178 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TO15178 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TO15178 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TO15178 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TO15178 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TO15178 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TO15178 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TO15178 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TO15178 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TO15178 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TO15178 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TO15178 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TO15178 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TO15178 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TO15178 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TO15178 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TO15178 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TO15178 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TO15178 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TO15178 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TO15178 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TO15178 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TO15178 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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