Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
CCDC160A6NGH7 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC160A6NGH7 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms