Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms